ในปี ค.ศ. 391 จักรวรรดิโรมันกำลังแตกแยกจากความขัดแย้งทางศาสนา ฮิปาเทีย นักปราชญ์หญิงผู้ยิ่งใหญ่แห่งอเล็กซานเดรีย ต้องต่อสู้เพื่อปกป้องคลังความรู้และวิทยาศาสตร์จากกลุ่มคริสเตียนหัวรุนแรงที่ต้องการทำลายทุกสิ่งที่นอกเหนือความเชื่อของตน ขณะที่สงครามกลางเมืองระหว่างศาสนากำลังจะพลิกประวัติศาสตร์โลก เธอต้องเลือกระหว่างความจริงที่เธอค้นพบกับความอยู่รอดของมวลมนุษยชาติ การต่อสู้เพื่อความรู้ครั้งนี้จะกำหนดชะตากรรมของอารยธรรมตะวันตกตลอดไป
