ในปี 1945 หลังสงครามโลกครั้งที่สอง ญี่ปุ่นกำลังฟื้นฟูประเทศจากความพินาศ แต่แล้วสัตว์ประหลาดยักษ์นามก็อตซิลล่าก็ถือกำเนิดขึ้นจากกัมมันตภาพรังสี กองทัพญี่ปุ่นที่อ่อนแอต้องเผชิญหน้ากับหายนะที่ใหญ่กว่าสงคราม อดีตนักบินกามิกาเซ่ผู้รู้สึกผิดต้องหาทางกอบกู้บ้านเกิด เขาร่วมมือกับทหารผ่านศึกและนักวิทยาศาสตร์เพื่อวางแผนสุดท้าย ภารกิจนี้คือการหยุดยั้งมหันตภัยที่กำลังจะกวาดล้างญี่ปุ่นให้สิ้นซาก
