โลกที่มนุษย์ต่างดาวอาศัยปะปนกับมนุษย์โดยไม่มีใครรู้ หน่วยลับที่ซ่อนตัวอยู่ภายใต้ชื่อ Men in Black มีภารกิจคอยควบคุมและจัดการสิ่งมีชีวิตต่างดาวที่แอบเข้ามาในโลก เจ้าหน้าที่เคย์มือเก๋าต้องรับสมัครคู่หูคนใหม่ เจ้าหน้าที่เจย์ ที่เพิ่งจากตำแหน่งตำรวจมา ทั้งคู่ต้องร่วมมือกันหยุดยั้งแมลงสาบต่างดาวที่บุกโลกเพื่อชิงวัตถุพลังงานสุดอันตรายที่ซ่อนอยู่ในสร้อยคอของราชวงศ์ต่างดาว
