เมื่อเด็กหนุ่มชื่อทิม กู๊ดแมน เดินทางไปหาไฮโซ พ่อนักสืบที่หายตัวไปอย่างลึกลับ เขาได้พบกับพิคาชูพูดได้ตัวหนึ่งที่สวมหมวกนักสืบ แต่ความแปลกคือมีเพียงทิมเท่านั้นที่ได้ยินเสียงของมัน ทั้งคู่ต้องร่วมมือกันสืบหาความจริงในไรเมอร์ซิตี้ เมืองที่มนุษย์และโปเกมอนอยู่ร่วมกัน โดยเผชิญหน้ากับแผนการร้ายที่เชื่อมโยงกับพลังลึกลับของโปเกมอนและความทรงจำที่สูญหายของทิม
