ในปี ค.ศ. 1639 มิชชันนารีนิกายเยซูอิตสองคนเดินทางไปญี่ปุ่นเพื่อตามหาครูของตนที่ถูกกล่าวหาว่าละทิ้งความเชื่อ ท่ามกลางการข่มเหงคริสต์ศาสนิกชนอย่างโหดร้าย พวกเขาต้องเผชิญกับความทุกข์ทรมานและความสงสัยในศรัทธาของตนเอง เมื่อต้องเลือกระหว่างการตายอย่างทรมานหรือการเหยียบย่ำรูปเคารพเพื่อแสดงการปฏิเสธพระเจ้า เสียงแห่งความเงียบของพระเจ้าทำให้คำถามเรื่องการเสียสละและความหมายของศรัทธาถูกตั้งขึ้นอย่างลึกซึ้ง